5月31日,记者从深圳市疾控中心获悉,截至5月29日下午14:00,疾控中心病原所新冠溯源团队已成功获得“5.21”疫情中穆某等11例境外输入关联新冠病毒无症状感染者病毒全基因组序列,序列覆盖度在98.9%-99.9%之间。
经分析,该11例无症状感染者的新冠病毒高度同源,均属于在英国发现的变异株B.1.1.7,推断穆某等11人属于同一感染来源或同一传播链。
结合流行病学调查数据,基本判定本起疫情为境外输入关联疫情,排除与辽宁、安徽、广州等国内其他地区近期局部疫情的关联性。个案12、13的基因测序工作正在进行中。
据了解,B.1.1.7变异株于2020年9月20日被首次报告,并迅速在英国广泛流行,目前已有130多个国家报道了B.1.1.7变异株。
该变异株包含25个特征性的氨基酸变异位点,其中的N501Y突变可以降低RBD关键残基的极性,从而提高新冠病毒与人体细胞表面ACE2受体的亲和力,意味着B.1.1.7变异株具备更强的传播力。
深圳市疾控中心建立了二代、三代测序平台。该项技术在传染病的病原学诊断,发现高变异、罕见以及新病原体方面具有极大优势,尤其在本次新冠疫情溯源中,发挥着重要的作用。
2021年5月21日下午,市疾控中心新冠病毒溯源团队接到紧急任务,对盐田区一例境外输入关联新冠无症状感染者穆某的样本进行溯源分析。从样本准备、文库构建,上机测序、序列拼接、基因比对、到撰写溯源分析报告,仅用27小时,大大短于国家标准76小时。
【记者】刘珊
【通讯员】深疾控